我们理解您的担心，但是，一般来讲，申请人在计算机软件著作权登记申请过程中提交的源代码、程序文档等材料是被严格保密的，除非经过公检法等部门的依法查 询，除申请人以外的其他人都无法接触到申请人提交的材料。《计算机软件著作权登记办法》中规定，“软件著作权登记时，申请人可以申请将源程序、文档或者样 品进行封存。除申请人或者司法机关外，任何人不得启封”。
另外，目前登记机关允许申请人对软件代码进行特殊处理后再提交，这种提交方式被称为“例外交存”。目前允许的例外交存方式主要有如下几种情况：

        A 对鉴别材料作例外交存：
　　（一）源程序的前、后各连续的3０页，其中的机密部分用黑色宽斜线覆盖，但覆盖部分不得超过交存源程序的5０％；
　　（二）源程序连续的前１０页，加上源程序的任何部分的连续的５０页；
　　（三）目标程序的前、后各连续的3０页，加上源程序的任何部分的连续的２０页。

        B 对程序文档的例外交存
　　文档作例外交存的，参照前款规定处理。

         通过上述途径，申请人的源代码等保密材料根本不会被泄露，请您放心办理软件著作权登记业务。